Länge sedan
Ett år efter Lord Voldermorts återkomst uppstår en klyfta mellan Hogwarts rektor Albus Dumbledore, som leder Fenixorden, och den fege trolldomsministern Cornelius Fudge, som vägrar tro på Voldemorts återkomst. Ett kallt krig uppstår mellan dem, och det blir inte bättre av att Fudge utnämner den strikta häxan Dolores Umbridge till Hogwarts överinkvisitor. Samtidigt blir Harrys och Voldemorts telepatiska kontakt, som uppstod när Voldemort misslyckades att döda honom, stärkt, och de kan nu känna och se vad den andre håller på med.
Boken slutar med att Voldemort till sist duellerar mot sin gamle fiende, professor Dumbledore, och flyr efter en svidande förlust.
Fenixorden är en grupp trollkarlar, bland andra Remus Lupin, Sirius Black och de vuxna medlemmarna av familjen Weasley, som kämpar för att få världen att förstå att den onde trollkarlen Lord Voldemort kommit tillbaka.
Rubeus Hagrid tar med sig sin halvbror Graupe, som är en äkta men småväxt jätte, från bergen.
Harry Potter och Halvblodsprinsen
Efter att Trolldomsministeriet äntligen har accepterat att Lord Voldermort har återvänt inleds "Det andra kriget". Många personer svävar i livsfara och ingen går säker någonstans, allra minst Harry Potter. I första kapitlet avslöjas det att Cornelius Fudge fått sparken och den nye trolldomsministern heter Rufus Scrimgor. I första kapitlet svär även Severus Snape den Obrytbara eden att skydda Draco Malfoy, som tagit över efter sin far, Lucius Malfoy som Dödsätare. Harry även blir hämtad av Albus Dumbledore hos familjen Dursley och tillsammans övertalar de den före detta läraren, Horace Snigelhorn, att återvända till Hogwarts för att återuppta sitt jobb, lärare i Trolldryckskonst, medan Snape får sitt önskejobb, Försvar mot svartkonster. Sista delen av lovet tillbringar Harry i Kråkboet hos familjen Weasley där han får reda på att Rons äldre bror Bill skall gifta sig med Fleur Delacour som var en av deltagarna i Trekampen i den fjärde boken. På Hogwartsexspressen blir Harry medlem i Snigelhorns lilla "favoritklubb" Snigelklubben tillsammans med bland andra Ginny Weasley, Neville Longbottom,Cormac McLaggen och en viss Blasie Zabini från Slytherin m.fl. Väl tillbaka på Hogwarts börjar Harry få privatlektioner av Dumbledore. Under dessa lektioner berättar Dumbledore om Voldemorts liv, karaktär och svagheter.
Harry når toppbetyg i trolldryckskonst (vars lärare nu är Horace Snigelhorn, medan Severus Snape blir lärare i Försvar mot svartkonster) genom att använda en gammal sliten bok (Avancerad Trolldrycktillställning) med många nedskrivna tips och noteringar i marginalen, varav en del visar sig vara farlig svart magi. Boken har tillhört "Halvblodsprinsen", vilket slutligen visar sig vara Snape. Det blir dock problem när Harry använder förbannelsen Sectumsempra, som står i boken, på Malfoy med följden att han blir allvarligt skadad, och Harry får långvariga straff. Harry möter åter kärleken, men det leder till komplikationer eftersom det är hns bäste vän Ron Weasleys lillasyster Ginny, som dessutom redan har en pojkvän, vilken hon dock så småningom gör slut med. Senare blir Ginny och Harry ett par.
Det uppenbaras att Voldemort har styckat av sex delar av sin själ och gömt dessa i fysiska föremål (horrokruxer) för att uppnå odödlighet. Ett av dessa föremål var den mystiska dagboken från den andra boken. Så länge någon av dessa själafragment existerar kan inte Voldemort dö.
Harry och Dumbledore beger sig till en klippig kust för att förstöra en av horrokruxerna. Den är gömd längst in i en stor grotta och för att komma dit måste Dumbledore offra blod till porten. Väl framme ber han Harry att tvinga honom att dricka den giftdryck som horrokruxen är gömd i. Dumbledore överlever, men på vägen tillbaka attackeras de av en hord Inferi som de driver bort med eld. När de kommer tillbaka till Hogwarts finner de att en grupp dödsätare, anhängare till Voldemort har intagit slottet. Dumbledore dödas av Snape, som lyckas fly.
Harry upptäcker att horrokruxen de hittat var falsk, och att det enda den innehöll var ett meddelande från någon som kallar sig R.A.B. Där står det att han eller hon stulit den äkta horrokruxen. Att upptäcka vem R.A.B är och ta reda på om han har förstört horrokruxen blir en del av upplägget i den sista boken, tillsammans med att förstöra resten av horrokruxerna och slutgiltigt försöka döda Voldemort.
